Засновниками Межигірського Спасо-Преображенського монастиря вважаються грецькі монахи, які в ІХ ст. вирили тут перші печери.
На відстані чотирьох кілометрів від Межигір’я знаходиться місто Вишгород, яке в Х ст. був улюбленою резиденцією княгині Ольги та інших київських князів.
У 1151 році в Межигір’ї зупинявся князь Андрій Боголюбський, який поставив тут кам’яну церкву Білого Спаса.
Після того як монголо-татари зруйнували монастир він був відроджений тільки на початку ХVI ст. Тоді тут були споруджені храми Святого Спаса, св. Миколая, свв. Апостолів Петра і Павла.